Родилась в городе Ленинград, РСФСР, СССР и получила образование режиссера кино в Санкт-Петербургском университете культуры и искусства. Начиная с 1999 года работает в качестве режиссера монтажа на различных кино- и телевизионных проектах. Член Союза Кинематографистов с 2009 года. Член Гильдии Кинорежиссеров с 2013 года. Всего на счету Марии Сергеенковой более 60 фильмов и сериалов, за 4 из которых она была награждена премией «Золотой орёл» в номинации «Лучший монтаж фильма» («Мы из будущего», «Брестская крепость», «Батальонъ», «Салют-7»). Также Мария работала над рекламными роликами, клипами, трейлерами и другими проектами. Кроме того, Мария отмечена премиями АПКиТ (Ассоциации продюсеров кино и телевидения) и Мумбайского международного фестиваля. С 2019 года является одним из кураторов и преподавателей программы «Режиссура монтажа» Московской школы кино.
