Происходил из польской семьи. После домашнего обучения поступил в Киевскую 4-ю гимназию, которую окончил в 1907 году, затем учился на юридическом факультете Киевского университета, одновременно слушая лекции историко-филологического. Литературная деятельность началась ещё в студенческие годы: первые стихи были опубликованы в 1912 году, а в 1913-м в «Киевской мысли» появились путевые очерки после поездки по Европе. В 1919 году в журнале «Зори» вышел рассказ «Якоби и „Якобы“». Кржижановский преподавал психологию творчества, историю и теорию искусства в Киевской консерватории и других учебных заведениях. В 1920 году познакомился с актрисой Анной Бовшек, ставшей его женой; вместе они выступали с литературно-музыкальными программами. В 1922 году переехал в Москву, преподавал в студии Камерного театра. В 1923 году там состоялась премьера его пьесы «Человек, который был Четвергом» по Честертону. В середине 1920-х активно работал в Государственной академии художественных наук; в 1925 году опубликовал повесть «Штемпель: Москва». Он стал известен в театральных кругах Москвы, проводил публичные чтения, однако редко публиковался и зарабатывал на жизнь внелитературной деятельностью — работал редактором в «Советской энциклопедии», писал сценарии и либретто. Среди его работ — сценарии фильмов «Праздник святого Иоргена» (1929) и «Новый Гулливер» (1933), инсценировка «Евгения Онегина» на музыку Прокофьева, либретто опер Кабалевского «Кола Брюньон» (1938) и Василенко «Суворов» (1942). Работа над «Онегиным» открыла для писателя «пушкинский период»: он создал несколько теоретических трудов, включая «Искусство эпиграфа (Пушкин)» и «Словарь эпиграфов». В 1930-х годах появился «шекспировский период», когда Кржижановский написал ряд исследований и статей о Шекспире. В 1920–1940-х годах он публиковался в журналах «Литературный критик», «Интернациональная литература», «Советское искусство», писал о Бернарде Шоу, истории театра и литературе. Наиболее плодотворными стали 1920–1930-е годы, когда были созданы пять повестей и шесть книг-новелл. Несмотря на известность, Кржижановскому не удавалось издать значительный объём прозы: отдельной книгой вышла только «Поэтика заглавий» (1931). Попытки напечатать сборники новелл или поставить пьесы завершались отказами. Он создавал свои книги как внутренне связанные циклы, объединённые идеей, а не временем написания. В 1939 году Кржижановский был принят в Союз писателей, однако это не изменило его положения. С 1940 года он почти не писал художественную прозу, ограничиваясь очерками о Москве времён войны и переводами польской литературы.