Холмс старается сложить свою жизнь заново после случившегося рецидива и нападения на Оскара. Партнерство Ватсон и Шерлока из-за неадекватных действий последнего находится под угрозой. В скором времени приедет Морланд Холмс, отец Шерлока, и он пытается сосредоточиться на деле пропавшей женщины, якобы погибшей от руки собственного мужа. Шерлоку и Ватсон предстоит пережить несколько неприятных дней и попытаться наладить свои отношения.
Морланд предложил Шерлоку и Джоан воспользоваться его связями, чтобы восстановиться в качестве консультантов департамента полиции Нью-Йорка. Пока нет другой работы, Ватсон берется расследовать дело об убийстве в сверхсекретной исследовательской лаборатории.
Шерлок понимает, что приезд его отца в Нью-Йорк сильно мешает ему, и тогда Холмс решает помочь Морланду в решении проблем с работой, а за это он просит всего лишь как можно быстрее покинуть город. В это же время Холмс и Ватсон занимаются расследованием двойного убийства.
Холмс и Ватсон занимаются расследованием убийства лаборанта, у которого была весьма необычная тайная жизнь. Активную помощь в расследовании оказывают нью-йоркские полицейские.
У Холмса и Ватсон есть теория о причине убийства археолога. Судя по всему, ученый обнаружил нечто во время своих поисков на свалке, за что и был в итоге убит. У Шерлока серьезные проблемы в отношениях с Альфредо, его наставником по трезвости.
Морланд предлагает Шерлоку и Джоан сотрудничество, которое пойдет в итоге на пользу всем троим. Холмсу предстоит исполнить роль неправильного консультанта.
Отчим Джоан Ватсон пишет роман основанный на ее совместной работе с Шерлоком Холмсом даже не спросив об этом свою падчерицу. В итоге выясняется в чем заключается основная проблема в их взаимоотношениях.
В ходе нового расследования Холмс и Ватсон будут разыскивать убийцу идеально копирующего почерк другого преступника, уже отбывающего срок за решеткой.
Холмс и Ватсон ищут хакера, ответственного за три убийства, в том числе смерть российского миллиардера, посещавшего Нью-Йорк. Кроме того, Джоан удивлена приглашению соло на ужин от отца Шерлока.
Зыбкое перемирие Холмса с его отцом терпит неудачу, когда Холмс и Ватсон узнают, что Морланд скрывает тайну, которая угрожает их безопасности. Кроме того, Холмс и Ватсон расследуют два убийства, связанных с некоммерческим колледжем и незаконными практиками найма.
Холмс и Ватсон должны найти убийцу без каких-либо вещественных доказательств, которые могли бы им помочь, после того, как в нью-йоркском морге взорвалась бомба. Кроме того, Ватсон подозревает, что детектив нью-йоркской полиции хочет взять матч-реванш, когда она просит проконсультировать её по делу.
Коллега капитана Грегсона из Отдела по борьбе с наркотиками просит Холмса организовать идеальное ограбление внутри хорошо вооружённого и практически неприступного лагеря байкеров, торгующих наркотиками. Кроме того, когда Ватсон помогает Фионе Хелброн, которая помогла ей в недавнем деле, она делает удивительное открытие о Холмсе.
Шерлок и Джоан ищут убийцу, который использовал ядовитые грибы, чтобы убить профессора и группу его студентов. Кроме того, Джоан встревоженная громким шумом по соседству, узнаёт, что её сосед Трент снимает свой дом через сайт, который занимается организацией больших вечеринок. Этот эпизод частично основан на романе «Этюд в багровых тонах».
Когда расследование Холмса о покушении на Морланда обостряет их натянутые отношения, открывается правда о личности матери Шерлока. Кроме того, когда убивают троих членов банды, Холмс и Ватсон удивлены тем, что пожилая женщина выступает как их главный подозреваемый.
Когда Ватсон сталкивается с тайной подругой капитана Грегсона, бывшим офицером полиции Нью-Йорка, она невольно участвует в расставании пары. Кроме того, Холмс и Ватсон расследуют убийство богатой женщины, которая оставила значительную часть своего состояния любимой собаке.
По настоянию богатого компаньона Морланда, Генри Баскервиля, Холмс и Ватсон расследуют гибель его брата и выясняют, что свидетель видел, как его преследовало большое, светящееся животное, слишком фантастическое, чтобы быть реальным. Кроме того, Шерлок считает необходимым вмешаться, поскольку травма от взрыва в морге негативно сказывается на работе судмедэксперта Хоса. Этот эпизод является адаптацией романа Собака Баскервилей.
Когда убивают человека, который тайно боролся с преступностью, одетый в костюм популярного супергероя комиксов, Холмс и Ватсон должны раскрыть его настоящую личность, прежде чем они найдут его убийцу. Кроме того, Морланд делает неожиданное пожертвование в любимый благотворительный фонд Ватсон, чтобы заставить её оказать ему услугу, связанную с его бизнесом.
Когда пропадает эксперт по выживанию, Холмс и Ватсон должны определить, ушёл ли он сам или стал жертвой преступления. Кроме того, Холмс демонстрирует странное поведение, когда его романтические отношения с Фионой достигают критической точки.
Таинственная женщина, которая организует подпольные игры в покер с высокими ставками, появляется на пороге дома Шерлока и Джоан и говорит им, что её жизнь в опасности, утверждая, что она - бывшая компаньонка Майкрофта. Однако, в процессе расследования, Джоан начинает подозревать, что их новая клиентка была с ними нечестна.
Когда Шерлок и Джоан расследуют убийство молодой женщины, они обнаруживают, что её смерть указывает на произведения искусства, которая связана с преступлением, когда она была в колледже. Вслед за шокирующим личным откровением, Джоан пытается наладить связь с недавней клиенткой.
Когда Холмс и Ватсон втягиваются в расследование двойного убийства, они обнаруживают, что жертвы инсценировали убийство, в тот момент, когда были убиты. Кроме того, наводчик Ватсон в офисе Морланда сталкивается с проблемой, которая угрожает уличить её в шпионаже за Холмсом и его отцом.
Отец Шерлока, Морланд, становится главным подозреваемым Шерлока и Джоан по делу об убийстве, после того, как одного из его сотрудников убивают под видом ограбления.
Когда Холмс и Ватсон вычисляют преступника, который стоит за покушением на жизнь Морланда, они обнаруживают шокирующую связь с собой.
Жизни Холмса и Ватсон находятся под угрозой из-за влиятельной, всемирной преступной сети, связанной с попыткой покушения на Морланда Холмса. Кроме того, обиды Шерлока на своего отца ставят под угрозу их союз, который может привести их общего противника к правосудию.