Оливия возвращается из странного путешествия в альтернативную реальность, а Питер старается получить информацию о её посещении, не зная о том, что над ним нависла новая опасность. Уолтер возвращается в лабораторию и готовится к дню рождения сына.
Оливия расследует дело об исчезновении 7-ми человек. Люди просто растворились в воздухе на глазах у свидетелей. Доктор Бишоп подозревает, что в деле опять замешана генная инженерия.
Оливия расследует дело о внезапно взорвавшемся человеке, бывшем военном, участником секретной операции "Железный человек". Все нити ведут в Ирак, где до сих пор разыскивают Питера Бишопа.
Поправляясь после травматичной и опасной встречи с основателем Мэссив Дайнемикс Вильямом Беллом, агент Данем употребляет весьма существенную дозу вещества, которое сделал доктор Бишоп для стимулирования памяти Оливии, что открывает для нее новые тайны параллельной реальности. Тем временем, команда "За гранью" исследует ряд загадочных случаев грабежа.
Доктор Наяк разработал микрочип, который, при вживлении в мозг человека, избавляет его от ночных кошмаров. Что-то пошло не так, и пациенты доктора Наяка умирают от переутомления, перед смертью нападая на людей. Команда "За Гранью" берется за расследование.
Таинственная тень превращает людей в пепел. Броилз уверен, что это продолжение дела четырехлетней давности. В тот раз погибло 5 человек, и он уже почти знал кто убийца, но ведущие умы ФБР так и не смогли распутать химическую формулу, которую в качестве подсказки подкинул убийца.
Полиция и ФБР расследуют дело о похищении сына одного из сотрудников Мэссив Дайнемик. Похитители обладают способностью контролировать разум людей, но требования, которые они выдвигают, ставят в тупик группу расследования.
ФБР давно известно, что на нашей планете живут т.н. "Наблюдатели" - абсолютно лысые мужчины, одетые в стиле 60х годов 20ого века. Наблюдатели регулярно появляются рядом с чрезвычайными происшествиями, входящими в "Образец". Кто они, откуда они - не знает никто, только доктор Бишеп имеет опыт общения с одним из Наблюдателей. И только он может помочь найти похищенную Наблюдателем девушку.
В США прибыл корабль с китайскими нелегалами. Все пассажиры мертвы, кроме одной женщины, которая выжила только потому, что не принимала таблетки от укачивания. След ведет в китайский квартал, к местным целителям. Доктор Бишоп, в борьбе за свою независимость, отправляется на поиски врача один.
Просматривая видеозапись из психиатрической лечебницы, где несколько неизвестных вскрыли мозг больному, Данэм опознает в одном из преступников умершего пациента крио лаборатории Томаса Ньютона. Между тем пытаясь разузнать о причине поступка злоумышленников, коллеги разыскивают еще нескольких людей с аналогичными отметинами на черепе. Выйдя на занимавшегося их лечением психиатра, напарники обнаруживают связь этого происшествия с прошлым Уолтера, который, тем временем, становится новой целью Ньютона.
Умершая от аневризмы девушка приходит в себя на операции по пересадке органов. Она без конца повторяет секретный код базы ВМС США и говорит на русском. Помочь разобраться в проблеме сможет только команда "За гранью".
По дороге в участок, полицейский подбирает сбежавшего из дома мальчика. При подъезде к участку мальчик превращается в уродливое существо. Вскоре, полицейский погибает, а перед доктором Бишопом встает очередная задача - вспомнить свое прошлое.
Незнакомец из Голландии умирает в холле офиса от непонятного вируса. Следом за ним умирает курьер из этого офиса. Бишопу придётся в кратчайшие сроки понять что это за вирус и как с ним бороться, ведь на кону в очередной раз оказывается жизнь Питера.
На еврейской свадьбе от удушья из-за странного токсина умирают все родственники жениха. Одна из жертв, бабушка жениха, пережила Холокост, что натолкнуло доктора Бишопа на мысль о своем отце Роберте, который эмигрировал в США в 1933 году. Или в 1943 году...
В центре Манхеттена произошло землетрясение, хотя это невозможно с геологической точки зрения. Доктор Бишоп практически сразу понимает, что речь идет об играх с параллельной вселенной.
Доктор Бишоп решил рассказать Оливии историю появления "параллельного" Питера.
Подразделение «За гранью» расследует ряд странных смертей, жертвы которых погибли от раковых опухолей, появившихся на их телах за считанные минуты. Оливия Данэм уверена, что между жертвами есть связь, но она ускользает от неё...
Целый вагон в поезде заполнен трупами, как будто что-то высосало всю энергию из людей, телефонов и mp3-плееров. Камеры слежения зафиксировали человека, вышедшего из вагона сразу же после трагедии, остается выяснить, зачем ему понадобилось это массовое убийство...
Пара подростков, балующихся травой, становятся жертвами оборотней, которые могут принимать облик любого человека. Оборотни под руководством Ньютона готовятся создать новую дверь между вселенными, а Питер как никогда близок к открытию тайны своего сущестования.
Уолтер, попробовавший очередную марихуановую смесь собственного изготовления, рассказывает Элле, племеннице Оливии, музыкальную «сказку» в стиле нуар о настоящей любви, смерти и предательстве.
Питер становится свидетелем убийства девушки из придорожной забегаловки маленького городка. Вместе с шерифом округа он принимается за расследование, которое, как ему кажется, должно привести к Ньютону.
Уолтер и Оливия отправляются в параллельный мир, чтобы предотвратить катастрофу. Впервый за долгие годы Уолтер Бишоп и Уильям Белл встретятся лицом к лицу...
Пока Уолтер и Оливия ищут Питера, их двойники пытаются им помешать. А сам Питер уже близок к разгадке принципа работы таинственной машины.