Усаги и её друзья живут спокойно, ничего не помня, даже своей дружбы. Когда появляются новые злодеи в образе двух пришельцев — Эйла и Анны, Луна возвращает Усаги память, и она превращается в воина.
Ами, Рэй, Макото и Минако случайно встречаются в ходе прослушивания на роль в фильме, но вмешательство монстра, посланного Эйлом и Анной, вынуждает Луну пробудить их воспоминания, чтобы они смогли противостоять новой угрозе.
Посланец инопланетян нападает на Синодзаки, друга детства Макото, так что ей приходится защищать его. Усаги безнадёжно пытается заставить Мамору всё вспомнить, даже пробудить в нем Такседо Маска. Наконец-то появляется новый загадочный герой-союзник, его зовут Рыцарь Лунного Света.
Усаги вместе с отцом и братом отправляется в аркадный центр виртуальной реальности, который является новой атакой инопланетян. Но в самый важный момент боя, силы Усаги дают сбой, не давая победить врага.
Во время любования цветением вишни демон нападает на Усаги и её друзей. Королева Серенити соединяет Серебряный Кристалл с медальоном Усаги, что и даёт ей новую силу.
Минако знакомится с девочкой из детского сада, которая считает своим кумиром Сейлор Мун. В это время Эйл и Анна решают, что энергия детей наиболее подходящая для них.
После атаки на ясли, Усаги и Мамору вынуждены присматривать за малышом, мама которого пострадала, закрыв сына собой.
Рей пишет песню для предстоящего школьного праздника. Эйл и Анна решают набрать энергии именно на этом событии, но сами невольно становятся участниками конкурсов.
Макото пытается привлечь к себе внимание Эйла, предлагая ему коробку с едой, тем самым вызывая раздражение у Анны.
Университетские друзья Мамору решили поставить спектакль "Белоснежка и семь гномов", но в итоге все участники поссорились, так что только Усаги и её подруги могут спасти положение. Анна надеется, что если она получит роль Белоснежки, то Мамору в роли принца поцелует её. Эйл ревнует и атакует представление с помощью демона.
Усаги и Анна остаются после занятий из-за того, что Усаги ела во время урока, а Анна наговорила непонятных слов на своем языке учительнице. В наказание им нужно выполнить задание по английскому, и они решают его сделать наперегонки, а победительнице достанется Мамору. Анне не хватает сил, и она пытается забрать энергию у Усаги. А тем временем воины вновь сражаются с картой Эйла.
На фестивале «Сейлор Мун» демон Ямандака забирает у людей энергию. Сама Усаги отправляется в дом к Седжуро и Нацуми, а Эйл и Анна отправляют Усаги в комнату, где Дерево Тёмного Мира берёт у неё энергию.
Дерево Тёмного Мира берёт энергию у Усаги и Мамору. Туда же проникают остальные Воины в Матросках, но Эйл и Анна пытаются их убить. Эйл и Анна узнают, что Усаги Цукино это Сэйлор Мун. Тогда Анна пытается проучить Сэйлор Мун, но Мамору жертвует собой, чтобы спасти Усаги. Рыцарь Лунного света пытался заставить раскрыть сердца Эйла и Анны, а дерево разозлилось. Анна жертвует собой, закрыв Эйла от ветви разъяренного Дерева, и признается ему в Любви. Дерево Тёмного Мира рассказывает свою историю. По просьбе дерева, Сейлор Мун очищает его своей силой любви и оно возрождается. Рыцарь Лунного света поведал Усаги о том, что он двойник Мамору, и на прощание пробудил память Мамору. Эйл и Анна забирают росток дерева на другую планету.
Во время свидания на Усаги и Мамору с неба сваливается девочка,представившаяся как Усаги. Она намеревается заполучить Серебряный Кристалл.А в это же время в Токио появляется космический корабль: Рубеус и сёстры преследовательницы собираются убить Малышку и уничтожить Серебряный Кристалл.
Мамору рвёт отношения с Усаги. Бертерайт распространила по ветру рекламу косметики, и буклет нашла Усаги. Она пошла в магазин косметики и там встречает ещё одного врага.
Ами должна улететь учиться в Германию. Девочки готовят ей прощальную вечеринку. Луна и Артемис дают воинам новые талисманы. Усаги снится сон, где Ами уходит, а вместе с ней и Мамору. Малышка и Мамору приезжают в аэропорт, чтобы попрощаться с Ами, и отдают ей прощальный подарок. Ами получает новую силу и спасает всех от гибели.
Дедушка Рэй и Юичиро устраивают изящную самооборону для красоты и здоровья девушкам. На них нападают враги. После того, как Сейлор Мун убила Демона, Кермесайт решает убить её, но Рей получает новую силу.
Демон устраивает грозу, пытаясь выманить Малышку, которая боится грома. Выясняется, что Малышка прибыла из другого времени. Серебряный кристалл нужен ей, чтобы спасти родителей. Воины в матросках пытаются выяснить подробности, но Малышка ничего им не говорит.
Усаги и Малышка, а также Макото с Минако нашли время ссорятся. При этом Минако мечтает найти парня, похожего на Алана. Когда Петсайт и Калаверайт, не веря о любви, посылают своего демона на них. Макото и Минако помирились своими новыми силами. Петсайт и Калаверайт отступают, а Сэйлор Мун уничтожила Демона. В конце Рэй и Усаги поссорились.
Наступает праздник Карри, но Малышка не умеет его готовить, Мамору тоже, и Усаги начинает учиться его готовить.
Девочки отправляются отдыхать на дальний остров. Малышка, отплывает далеко и начинает тонуть, её спасает динозаврик. Тем временем Усаги и её подруги ищут Малышку по морю до самого острова с вулканом.
Малышка описалась в постель, а Усаги набросилась за это на неё. Малышка расстроена этим и хочет вернуться в будущее, но её находят враги.
Мамору снится страшный сон о том, что с принцессой Серенити произойдёт нечто ужасное. Враги с помощью демона усыпляют Сейлор Мун. Луна спешит на помощь к Мамору. Потому что никто кроме него не может разбудить Сейлор Мун.
Кермесайт отправляется в часовню Хикава за Малышкой. Рей предстала перед Кермесайтом Сэйлор Марсом, и они противостоят друг другу. От этого пострадали Юичиро и сама Марс. Воины в Матросках обезвреживают Кермесайт. В конце серии Сейлор Мун исцеляет Кермесайт, и та превращается в человека.
Бертерайт отправляется в шахматный клуб, и выходит в финал шахматного турнира с Ами, которая выигрывает. Помешательство Такседо Маска Бертерайту победить Воинов в Матросках заставило обеих сестёр предать её. Но Кермесайт перемирила свою сестру. Бертерайт становится человеком.
Калаверайт и Петсайт устраивают засаду воинам в матросках. Малышка узнает кто на самом деле Сейлор Мун и остальные воины Калаверайт и Петсайт становятся людьми.
Малышка Усаги украла брошь с серебряным кристаллом, и хотела вернуться в будущее. Но на неё напал Рубеус. Воины в Матросках пытались защитить её, и сами попали в руки Рубеуса.
Усаги и Малышка оказались на НЛО Рубеуса. Тот использовал Сэйлор Мун, как лягушку. Но Сейлор Мун не сдаётся, пыталась очистить Рубеуса от злых чар Чёрного Кристалла, нежели без серебряного кристалла. Зато Малышка обезвредила усилитель их врага. Девочки освободили воительниц. Но Рубеус создал пожар на своём корабле. Воины в Матросках вместе с Малышкой телепортировались обратно на Землю, а Рубеус был изгнан Изумрудом. Он погиб на этом корабле и его прах развеялся по космосу.
После гибели Рубеуса, этим делом начали заниматься Изумруд, Сапфир и Принц Алмаз: они выпускают чёрный кристалл так, чтобы демон вторгся в прошлое малышки. Воины в матросках уложили малышку в постель. В этой серии впервые появляется Сейлор Плутон. Воины в матросках в сознании малышки воспользовались ситуацией - Сейлор Мун уничтожает демона, потом они провожают малышку до её мамы.
Теперь Изумруд создаёт демонов. Она создала демона, который превращают людей в пирожные.